施用氮肥可以讓農(nóng)作物生長地更加好，同時氮肥也可以為土地的改善作出貢獻，但是過量施加氮肥會對環(huán)境造成影響，合理把握這個量會讓各方面都進入好的狀態(tài)。
“氮肥過量施用后，浪費的氮肥大量進入自然環(huán)境，對環(huán)境造成了很大壓力！敝煺琢贾赋，根據(jù)上述華北地區(qū)對小麥施氮量的研究，在合理用量下，氮肥的損失量是每公頃25公斤進入環(huán)境；而按照農(nóng)民的施肥量，氮肥的損失量是71公斤，環(huán)境壓力增大了2.8倍。
氮素對環(huán)境破壞典型的例子是2007年太湖出現(xiàn)藍藻。雖然大多數(shù)人認為工業(yè)污染造成了這一后果，但朱兆良認為大量損失的氮肥向水體遷移，也是水質(zhì)變壞的一個原因。
“這是一個歷史漸進的認識過程。70年代我就向當?shù)氐霓r(nóng)業(yè)局提過，說氮肥施多了，但他們根本聽不進去！痹鴵沃袊r(nóng)工民主黨十三屆中央委員會副、江蘇省政協(xié)副的朱兆良記得，1998年太湖氮磷含量已經(jīng)超標，出現(xiàn)富營養(yǎng)化。
這一年全國政協(xié)開會時，朱兆良向中央主要負責人提出了氮肥過量使用的問題。半年之后，他在發(fā)布的《中共中央關(guān)于農(nóng)業(yè)和農(nóng)村工作若干重大問題的決定》中發(fā)現(xiàn)有這樣一段話：“要控制工業(yè)、生活及農(nóng)業(yè)不合理使用化肥農(nóng)藥對土地和水資源的污染！
“具體讓地方上采取控制，需要一個復雜過程！敝煺琢贾赋，“過去非常強調(diào)肥料早期的釋放，而且主要是施在土地表面，這時候作物的根系很弱，氮肥很容易損失！
他強調(diào)，化肥施用引起的是非點源狀污染。它雖然目前還沒有導致糧食產(chǎn)量明顯下降，但對設(shè)施蔬菜等產(chǎn)生的影響已經(jīng)非常常見。
根據(jù)中國農(nóng)科院在北方五省20個縣集約化蔬菜種植區(qū)的調(diào)查，在800多個調(diào)查點中，50%的硝酸鹽含量超標。
氮肥氣態(tài)損失同時帶來了溫室氣體排放：氮在土壤微生物的硝化和反硝化作用下，使部分氮肥變成了氧化亞氮這樣的溫室氣體。